Các biến chứng thường gặp của bệnh trào ngược dạ dày thực quản ở người lớn: viêm thực quản trào ngược, loét thực quản, hẹp thực quản, loạn sản niêm mạc thực quản, ung thư thực quản, viêm thanh quản, ung thư thanh quản, ho kéo dài, viêm phổi tái diễn …


Ở trẻ em, trào ngược dạ dày thực quản là một trong những nguyên nhân khiến trẻ nôn nhiều, từ chối không chịu ăn hoặc bỏ bú. Hậu quả là làm cho trẻ suy dinh dưỡng, thiếu máu, viêm đường hô hấp do hít phải chất trào ngược…


Nguy hiểm hơn là luồng trào ngược dạ dày có thể gây ngừng thở và đột tử do ngừng tim. Nguyên nhân là do dịch vị đã kích thích vào các thụ cảm thần kinh và dây X. Biến chứng này hay gặp ở trẻ nhỏ, nhất là những tháng đầu sau đẻ.